Pogrzeb o. Kazimierza Žilysa SJ odbył się 19 lutego 2021 roku. Mszy św. o godz. 10:30 w Sanktuarium św. Andrzeja Boboli w Warszawie przewodniczył Ks. Biskup Rafał Markowski, a kazanie wygłosił Ks. Biskup Józef Staniewski z Grodna.
W kazaniu przywołał Adama Mickiewicza i jego inwokację: „Litwo Ojczyzno moja, Ty jesteś jak zdrowie”. Przypomniał św. Kazimierza królewicza, którego imię zmarły jezuita nosił i powiedział, że o. Kazimierz duszą swoją chwalił swego Pana i Ojczyznę. „Papież Franciszek mówi, że życie to nie czas, który przemija – przypomniał ksiądz Biskup – życie to czas spotkania, szczególnie życie i posługa kapłana”. Podziękował w imieniu wszystkich wiernych na Białorusi i ich pasterzy za dar, jakim było życie ojca Kazimierza, za czas jego posługi i czas spotkania z nim”. Wspomniał także swoje osobiste spotkanie z ojcem Kazimierzem w 1984 roku.
Pod koniec Eucharystii głos zabrał Ambasador Republiki Litwy w Polsce, Pan Eduardas Borisovas, który powiedział, że o. Kazimierz był całym sercem zaangażowany w życie litewskiej społeczności w Polsce. „Mieliśmy wiele pomysłów i planów, których nie zdążyliśmy zrealizować, jednakże bez wątpienia będziemy je kontynuować. W osobie śp. ks. Kizimierasa straciliśmy patriotę, bowiem uczył swoich wiernych prawdy, miłości ojczyzny, poszanowania tradycji, szacunku do historii i człowieka. Zawsze będziemy pamiętać jego życzliwość, mądre słowa i pouczające wspomnienia z przeszłości”.
Na zakończenie uroczystości w Sanktuarium o. Wojciech Żmudziński SJ odczytał listy kondolencyjne, jakie napłynęły od biskupów z Białorusi oraz w imieniu Przełożonego Prowincji Wielkopolsko-Mazowieckiej Towarzystwa Jezusowego wyraził wdzięczność wszystkim, którzy łączą się dzisiaj w modlitwie za ojca Kazimierza. Śp. o. Kazimierz Žilys SJ spoczął w grobowcu jezuitów na Starych Powązkach.
Poniżej linki do listów kondolencyjnych, jakie napłynęły od księży biskupów z Białorusi:
Jego Ekscelencja Ks. Arcybiskup Tadeusz Kondrusiewicz
Jego Ekscelencja Ks. Aleksander Kaszkiewicz – Biskup Grodzieński
Jego Ekscelencja Ks. Antoni Dziemianko – Biskup Piński
Jego Ekscelencja Ks. Oleg Butkiewicz – Biskup Witebski
W tych dniach o. Kazimierz Žilys SJ został uhonorowany odznaką „Za Zasługi” przyznaną przez Departament Mniejszości Narodowych i Uchodźstwa przy Rządzie Republiki Litewskiej.
